朱允炆让齐泰和黄子澄以后要做什么事知会自己一声，哪怕是母妃那边的吩咐，也要告诉自己。同时，他命人去告诉蓝玉，若想脱身，只能攀咬，把这件事闹大，闹大到连陛下也不敢轻举妄动。蓝玉身体力行，立刻开始攀咬主审官詹徽，污蔑他在都察院口腹蜜剑，是个两面三刀的小人，更是自己的党羽。詹徽担心一旁的齐泰会听信蓝玉的话，一再阻止无果，最终承认与蓝玉有牵连，结果被齐泰命人剥去官服，下狱听勘。

齐泰又从蓝玉口中确认其与曹震、詹徽都有关联，此案涉及朝中官员甚多，齐泰不敢擅专，遂禀明陛下。朱元璋让锦衣卫指挥使蒋瓛对一干人等全数一体缉拿。道衍看得明白，他告诉朱棣，陛下之所以捉拿十三位侯爵等人，是为了敲打这些功勋权贵，毕竟皇太孙尚且年幼。至于给蓝玉出主意的这人，摆明了是要让蓝玉这个莽夫死无葬身之地。朱允炆去求朱元璋饶了蓝玉，连额头都磕青了，可这却更加让朱元璋下定决心要杀蓝玉。

洪武二十六年，一代名将凉国公蓝玉以谋逆罪下锦衣卫狱，朱元璋遂借此再兴大狱涉案官员，计十三位侯爵、两位伯爵及吏部尚书，朝中功臣宿将牵连殆尽，是为明初之蓝玉案。此大案后，朱元璋下令裁撤锦衣卫，焚其刑具，锦衣卫千户以上者，前往晋王军中效力。远在北平的朱棣，始终在想该怎样才能让父皇允许妙云带三位儿子回来。诸位世子协同皇太孙一起批阅奏章，可燕世子对其中一份错字甚多的奏章并未打回去。

朱元璋问其原因，这才知道这份奏章是一位武将转文官的官员所写，本来大字不识一个，但如若和文官一起比，倒有失公允。朱元璋倒也没再说什么，让朱高炽陪自己出去走走，答应让他和妙云尽快回去和朱棣团聚。洮州叛乱，朱元璋命秦王带兵前往洮州平叛。妙云听朱高炽说陛下准允他们回北平，她却毫无喜色，在她看来，这绝非是一个好消息。秦王平叛前上表，不求赏赐，只希望父皇能放过王月悯。

谁知天公不作美，秦王平叛时染上了瘴疫，命不久矣。他撒手人寰前，把王月悯托付给另一个王妃，但王月悯没有苟活，在秦王朱樉的灵柩前举刀自杀。朱元璋追封朱樉为愍王，许王月悯与秦愍王合葬。朱元璋将妙云叫进宫，叮嘱了她几句话，让她带几个太医回去，给燕王将养，而微胖的朱高炽，也要调养。

公元1396年，洪武二十九年，朱元璋令朱棣兵进塞北，发动了洪武年间，明廷对漠北北元势力的第八次，也是最后一次大规模进攻。战场厮杀，终将这持续了十几年的明廷和北元之间的战争，画上了句号。朱元璋收到加急捷报时并无意外，直接让人归档了。不久后，朱高炽的妻子诞下一子。