祁老爺生病，認爲是祁無雙給他帶來的災難，便吩咐下人將祁無雙丟到郊外。若不是祁無極及時趕到，祁無雙早就被羣狼生吞活剝了。祁無極重新將祁無雙帶回祁家，護着他長大，隻身帶着弟弟去仙島求醫問藥。兄弟倆在路上遇到夜箜鳴，祁無雙對她一見鍾情，但夜箜鳴愛的人卻是哥哥祁無極。夜箜鳴雖是一介女流，但她勇敢追愛，得知祁無極要帶着祁無雙去仙島，她竟也要執意前往。虎子和祁曉軒認出夜箜鳴手中的玩偶是一眉的真身，那時候的一眉還沒有人形，只是一個毫無溫度的玩偶。

他們還沒啓程前往仙島，就遇見了後來千羽國的開國皇帝王千羽，虎子和祁曉軒發現王千羽和王羽千長得非常地相像。當時疫病頻繁，王千羽本要前往仙島求醫問藥，只可惜他在臨行前也染上了疫病，無法前往，只好請求祁無極抵達仙島後爲他們求願，望神仙能解蒼生之苦。一路跋涉，衆人終於來到巔峯谷。夜箜鳴發現祁無極和白虎相愛，心情鬱悶難過，祁無雙開導她，並勇敢向她表白求愛。夜箜鳴惱羞，直言她喜歡的是祁無極，對祁無雙好也是因爲他是祁無極的弟弟，所以愛屋及烏。

祁無雙再次遭到打擊，心中充滿怨懟，對這不公的人生，對這殘廢的雙腿。祁無極的話讓他重燃希望，他抱着最後一絲希冀跟隨哥哥找到大山神，但大山神只能實現祁無極一個願望，祁無極要在救治弟弟雙腿和拯救百姓黎民之間做出選擇。祁無極分得清孰輕孰重，他選的是清除疫病，他的做法引得祁無雙震怒，滿腔的怨念讓祁無雙從人變爲妖，一躍而起奪了金剛橛斬殺了大山神，後又蠶食祁無極的軀體和靈魂，成了祁無極的樣子。祁無雙大手一揮，妖帝之心迸發冥焰，形成毀天滅地的冥海。

至此，祁曉軒和虎子終於明白祁無雙滔天的怨念從何而來。而解開祁無雙的怨念，才能淨化冥海的海水，兩人的做法是讓祁無雙帶着記憶從頭開始，詢問祁無極該做什麼選擇。祁無極還是會選擇天下蒼生，但他同時也會想盡一切辦法醫治弟弟的雙腿，哪怕是用他的腿來換也在所不惜。聽到哥哥這些話，祁無雙感慨，鬱結的五百年的心豁然開朗，怨念也隨之如風消散。怨念消除，虎子和祁曉軒耗費神力，終於淨化了冥焰，遠在伏龍灣的將士們忽然看到冥海的海水變清了，他們爲此歡呼和雀躍。

巔峯谷恢復往日榮光，虎子決定留在巔峯谷，守衛這裏的英烈。他送祁曉軒、霄雲子衆人上乘黃號，他們這一別，不知何時才能再相見。回到大陸後，兏羍猐、金花三姐妹成爲伏龍國國御妖師的中流砥柱，祁嫣然供奉奶奶的靈位，烏里丹親手將馨彤的牌位放到揚名堂裏。成濟年和阿牙在一起了，阿牙對他的要求很高。一位德高望重大娘給祁曉軒算命，坦言他和虎子的故事還未落幕，他們還會有再相見的時候。

全劇終。