鍾教授在舞會給大家作出總結，原子彈研究過程中還存在許多難關需要突破，即使是這樣，難關最終可以度過，因爲原子彈羅布泊研究基地就要建成，這項壯舉是全國人民和毛主席都在看着的，必須要有信心完成。丁香局喝醉酒詢問黃凱華爲什麼要放棄槍式，那麼多同志沒日沒夜地研究理論，是黃凱華說放棄就放棄的嘛，丁向軍始終無法理解黃凱華背叛槍式的原因，丁向軍只在乎最終原子彈成功榮譽沒有自己，黃凱華勸說丁向軍不要太在乎個人榮譽，但是丁向軍根本無法放棄自己的前途和地位這讓黃凱華很是失望，丁向軍已經在歧路上無法挽救。

舞會散場，陶志綱將楊佳蓉留下的字條交給王懷民，原來是振理高燒住院。鍾心因爲王懷民對自己的態度有些傷心在陶志綱面前紅着眼讓陶志綱有些奇怪。王懷民匆忙趕到醫院，看着楊佳蓉被雨淋溼卻依然照顧振理，急忙拿毛巾爲她擦拭，舉手投足間情意暗顯。振理生病需要陪牀但是王懷民沒有時間，楊佳蓉再一次主動承擔，王懷民感謝楊佳蓉這些年爲自己和振理的付出，這些也是別人無法替代的。楊佳蓉說自己一直在研究輻射防護，有一天也能成爲科學家，王懷民堅信不疑。王懷民對楊佳蓉產生了感情但是卻害怕愛上別人的那一刻何吟薇在自己心中消失。

鍾心向父親鍾教授求助關於中子源研究的材料問題，鍾教授近期出差中可能可以給鍾心帶回，但是當鍾教授問起鍾心與王懷民的問題時，鍾心避開了。楊佳蓉向牛玲請求去最艱苦的地方實習，但是牛玲考慮到楊佳蓉太過年輕不放心其去冒險，但在楊佳蓉的再三懇求勸說下還是成行。彭雄飛在食堂遇到身穿工作服的李彩蘭，這才知道李彩蘭竟然留在了A所食堂上班。彭雄飛質問彩蘭爲何會在食堂，留在A所工作是陶志綱安排的，還鼓勵兩人談戀愛，彭雄飛被彩蘭的一番話說的無語，旁的人還讓彭雄飛早日把婚禮辦了。張來因爲被撞工作包被特務掉包。

特務“信鴿”潛入實驗室竊密，鍾心正好去實驗室工作，時間過了許久鍾心依然沒有完成計算，特務心急打算刺傷鍾心，正巧王懷民來找鍾心正好瞥見特務留在桌上的張來的包，意識到可能是有壞人潛入，要拉走鍾心卻被特務阻攔，搏鬥中王懷民爲保護鍾心受傷，幸好陶志綱及時趕到抓住特務。隨後封鎖全所不容許一個人外出，嚴格檢查證件，審問特務抓住同夥張炎卻被其服毒自盡。鍾心盯着受傷的王懷民讓其很不自在，本來已經對王懷民心如止水的鐘心因爲這件事情對王懷民再次愛慕，王懷民還是無法思考感情問題。

王懷民從石紅英嘴裏得知楊佳蓉出差但很快會回來，鍾教授被特務襲擊也受傷入院。特務事件雖然沒有造成太大損失，但陶志綱得知特務“古扇”潛伏北京伺機而動。這些特務都是在大學時期就埋下的棋子，傅首長教育陶志綱不能像上戰場打仗一樣，要學會像科學家一樣思考問題，陶志綱願意爲這件事情承擔處分。鍾教授中度腦震盪但是不想住院耽誤出差時間也不想轉院治療。

鍾教授留住王懷民和鍾心特意撮合二位的事情，王懷民以原子彈原理作爲例子說明自己與鍾心之間的不可能，鍾心完全明白王懷民的心意。沒有更換新通行證的彭雄飛險些被衛兵當成特務，好在黃凱華及時爲彭雄飛解釋這才被放行，接着又給彭雄飛解釋新證的事情，新的通行證制度保障安全的同時，又給科學家們帶來了麻煩。王懷民找到陶志綱要求更換高級證件可以全所通用，被陶志綱拒絕。鍾教授也對傅首長提出了新證件的缺點部分，但是所內根本原則是信仰問題，所以不能放寬限制，大家都在苦惱時陶志綱卻主動提出信任王懷民。