慈禧率眾妃到庙中礼佛，光绪与珍妃在庙外跪拜，请慈禧停止向联军宣战，慈禧觉得光绪向西洋诸国屈服，不配為人君。光绪愿退位让贤，以请慈禧收回成命。慈禧以為光绪受珍妃唆摆威胁她，命人掌摑珍妃，光绪哀求至吐血晕倒。怀安向杜仲单打，认為有人多管閒事，引起光绪关注外间事，使他未能安心静养。1900年八国联军攻入北京，载漪和载灃接慈禧离宫西狩，玉贵到瀛台接走光绪，但独留珍妃在北三所，光绪嘱杜仲接珍妃跟上大队。

伏苓留下珍妃躲藏 

杜仲带珍妃和伏苓离开紫禁城，遇上英军杀入。杜仲指珍妃和伏苓是宫女，才获英军放行。紫禁城到处被联军掳人放火，杜仲要伏苓带珍妃往小屋躲藏，他则去救其他宫女。葛根返存仁馆保护各人，金赞到杜家接走百合。伏苓和珍妃等了一段时间，尚未见杜仲回来，伏苓决定外出找杜仲，留下珍妃躲藏。伏苓在宫中遇见到一联兵穿朝服的男子，以為是杜仲，奋不顾身拯救，冷不防联兵从后刺杀伏苓，这时杜仲扑出挡了一刀。二人赶返小屋，珍妃已不知所终。德龄到存仁馆找葛根，却被铁骨胁持走入存仁馆躲避洋兵追杀。 

杜仲伏苓各怀心事 

杜仲邀伏苓到家中暂避，两人閒聊，讲述她当年与鸿儒离开北京到广州，因生活逼人，伏苓也外出打工帮补生计，直至有晚下班回家不见鸿儒，他留书谓不能再吃苦，此后她再没见过他。杜仲讚赏她曾有一段轰轰烈烈的爱情，伏苓却羡慕他与百合无风无浪过日子。半夜，伏苓与杜仲各怀心事，伏苓拿着玉珮嗟嘆下半生要孤独终老，无聊下拿起杜仲的医书翻阅，竟找出杜仲写的诗，想起当年离开杜仲的情景，令她增添几分愁绪，时杜仲送厚被给伏苓保暖，伏苓的手无意中触碰杜仲，杜仲也添惆悵。翌日锡庚找杜仲返太医院收起藏书，这时日军大佐领兵进驻，他要御医交出《青囊书》。

杜仲救治日帅枪伤 

杜仲向大佐推荐锡庚能默写《青囊书》内容。杜仲要锡庚将他多年行医心得写出来，既瞒天过海，又可拯救太医院各人。伏苓等候杜仲多时尚未见他出现，折返太医院，只见数位太医，独不见杜仲，担心他有意外。待大佐出现时，伏苓向大佐袭击，混乱间枪伤大佐，伏苓被副官擒获。杜仲和锡庚已默写完医书走出房间，看到大佐流血不止，杜仲请缨為大佐做手术，但要保证不可伤害各人。杜仲凭着他曾看过泰来神父做手术，成功取出子弹，大佐手术成功身体无恙。大佐答应放过太医院各人，唯独用枪指着伏苓……