美國海軍科羅拉多號彈道導彈核潛艇性能優異、火力強大，堪稱完美的戰爭機器。它載有18枚多彈頭核導彈，足以震懾任何強大的對手。科羅拉多號由實戰經驗豐富的海軍上校Marcus Chaplin負責指揮，他耿直善良，有正義感，從不屈服於任何壓力。與之相反，美軍的高級將領們只會一天到晚圍繞在總統左右溜鬚拍馬，曲意逢迎。現在總統面臨彈劾危機，將領們的命運也發生鉅變——有的辭職，有的觀望，還有的站到了總統的對立面。國內的政治鬥爭本來和科羅拉多號上的官兵沒有多少關係，但一條可疑的指令改變了一切——這條來自加密通訊頻道的指令命令科羅拉多號從南極洲的停靠點向巴基斯坦境內發射核導彈。Chaplin的第一反應就是要求國防部副部長確認指令，但副部長竟出人意料地解除了Chaplin的職務，讓副指揮官Sam Kendal接管科羅拉多號。儘管Kendal是一名忠誠的軍人，在家鄉還有一個美麗的愛妻，但他和Chaplin一樣不願意殺害無辜的人。美軍精銳的太平洋艦隊立即向科羅拉多號開火，艇上的官兵差點全都葬身魚腹。

美國政府內部通報稱科羅拉多號已經叛變，要求艦隊不遺餘力地繼續追擊他們。走投無路的情況下，科羅拉多號只好轉向太平洋腹地的聖瑪麗娜島尋求避難——北約組織早年曾在這裏設立預警監聽站。但這些軍人的麻煩還遠沒有結束：聖瑪麗娜島上土著居民的「鎮長」Julian Serrat對這羣突如其來的入侵者十分反感，而艇上的海豹突擊隊軍官James King似乎正在執行一項Chaplin和Kendal都不知道的絕密任務。

另一方面，美國政府卻對世人宣稱巴基斯坦政府攻擊了科羅拉多號，唯有軍火承包商Kylie Sinclair不相信政府的鬼話——她的「消息源」向她證實官方的說法並非真相。她帶着疑問去找Arthur Shepard將軍，Shepard將軍也同意她的觀點——因爲他的女兒Grace就在科羅拉多號上服役。

從這一刻開始，這個令人費解的陰謀將推動世界格局發生鉅變。