羣嶺山峯之處，崑崙仙院就坐落在雲端深處，彷彿天地靈氣皆聚集於此。哪吒與小龍女、摩昂二人最後一個前來，楊戩才操縱法寶，打開結界，帶着衆弟子進入仙院之內。在這衆多弟子當中，還有兩個妖界J細混入其中，更是看不起哪吒這個凡人之軀。

太乙真人親自前來，爲新弟子們介紹他們的各業老師，並鄭重囑咐雲仙洞乃是仙院禁地，絕不能隨意進入，這反而引起了弟子的好奇，也讓兩個臥底，金銀二寶懷疑妖族大帝很可能就是被囚禁在此處。他們此次是身帶任務而來，自然不能在仙院惹是生非，況且，哪吒是小龍女的朋友，自然也就有龍族太子摩昂相護。

哪吒身爲三千年來，第一個可以進入仙院的凡人，也引起了衆人的注意。這第一課就是飛天之術，哪吒借用天兒師傅的法寶，第一次嚐到了可以飛天的滋味。只可惜，不論飛天還是陣法都一竅不通，深受同學們的嘲笑，再聞炎姬所言，凡人修仙需千百年，更是嚇得再也不要修習法術。

哪吒前身是爲太乙真人坐下靈珠子，接玉虛法旨，下界誕於陳塘關李靖門下，出世名爲哪吒。故而，就算李靖千般不願，也無法阻止玉鼎真人將哪吒接來崑崙仙院。此番，太乙真人必要將哪吒再次訓練成才，望能早日得道，成爲仙界有用之才。

金寶與銀寶深夜潛入雲仙洞，誤中機關，只得暫時無功而返，倒讓太乙真人發覺有人闖入，卻終究不知是何人所爲。此間插曲暫了，哪吒無意中碰得小龍女手中寶物，誰知那物竟發出銀鈴般地說話之聲。只見一個名喚水精靈的女孩從寶物中現身，三人便從此成了朋友，玩耍嬉鬧。

轉眼，又到了上課的時辰，哪吒卻一個人躲在亭中，再見前來勸慰的小龍女，竟拉着她前往禁地雲仙洞。天兒師傅正巧路過，連忙阻止二人，哪吒本就有意離開崑崙仙院，卻因此次犯錯，以不與太乙真人彙報換來他甘心留在仙院修煉。

哪吒、小仙女和摩昂一同修煉，時光流逝，很快就成了少年少女之狀。金寶和銀寶因爲真身乃蛙，故而一直保持着孩童的狀態，反倒給就他們機會，反過來嘲笑二人身高，也算是風水輪流轉。

天妖星蔽日之期將至，或許就意味着崑崙仙院的劫數將至。妖族大帝果然被囚禁在雲仙洞之中，整整五百年光景，他的怨氣早已沖天，正等着這次機會破封印而出。妖族之人早已籌備良久，金銀二寶也分頭偷盜小龍女的金水令牌和楊戩解開仙院結界的法寶。

雲仙洞內，哪吒三人追銀寶來此，一番打鬥倒反而讓金水令牌解開了妖族大帝的結界。一時間，仙院結界被破，妖族衆人一舉攻入崑崙仙院，如此情況危機之時，太乙真人卻不知去往何處，竟不在院內。

妖族大帝出來的第一件事，就是想要摧毀煉化封印他五百年的玉仙輪，誰知竟然哪吒機緣巧合吞服而下。哪吒以自身性命相護，竟就此讓玉仙輪臣服於他，二人合力與妖族大帝相鬥。